ODTÜ Logo

Merkezi Laboratuvar

Moleküler Biyoloji, Biyoteknoloji AR-GE Merkezi

 
  Ana Sayfa   Hakkımızda   Çalışanlarımız   Duyurular   Bağlantılar   English
Giriş > Ana Sayfa > Cihazlar > Protein Sekans Analiz Cihazı
Protein Sekans
Analiz Cihazı

 

Cihazlar

 

Otomatik DNA Analizi Cihazı

Yüksek Verimli DNA Sentezleme Cihazı

 

Lazer Taramalı Konfokal Mikroskop

Yüksek PerformansSıvı Kromotografisi

Hızlı Performans Sıvı Kromatografisi

UV-Vis Spektrofotometre

Eliza Okuyucu

Cam Kürecikli Hücre Parçalayıcı

Vakum Konsantrasyon / Liyofilizasyon Cihazı

Yüksek Basınç Hücre Parçalayıcı

Mikroizotermal Titrasyon Kalorimetre

Zaman Tanımlı Floresans Spektrometre

PCR Cihazı

Pulsed Field Elektroforez

Dikey Elektroforez

Yatay Elektroforezler

Elektroforez Güç Kaynakları

Hibridizasyon Fırını

Rotary Evaporatör

Vakumlu Kurutma Fırını

Klorofil Florometre

İklim Dolabı

Yıkama ve Dezenfekte Etme Ünitesi

Sayısal (Dijital) Platform Çalkalayıcı

Gaz/Duman Koruyucu

Analitik Tartılar

Güvenli Kabin

N2-O2-CO2 Kontrollü Etüv

Buz Yapma Makinesi

 

Analiz Başvuru Formu (DOC, ODT, PDF)

 

Protein Sekans Analiz Cihazı

PROCISE 491 HT

The Procise Protein Sekanslama Sistemi protein/peptidlerin N-terminal amino asitlerini sırasıyla keserek, oluşan fenilthiohyantoin (PTH) bağlı amino acid kökünü analiz eder.

Procise sisteminde kullanılan kimyasal proses, 1950 yılında P. Edman tarafından geliştirilen protein ve peptitlerin aşamalı olarak bozunmasına dayalı teknikden türetilmiştir. Edman Degradasyon Tekniğinde, bir proteinin amino ucu spesifik olarak phenylisothiocyanate (PITC) ile reaksiyona girer.

Procise Protein Sekanslama Sistemi Edman Degredasyonu Tekniğini ve PTH- amino asit analizini tamamıyla otomatik hale getirmiştir. Sistem HPLC ayırma, veri sayısallaştırılması, ve protein sekanslama raporu işlemlerinin tümünde tam otomasyon sağlar.

Örnek, sekanslama işlemi süresince sıcaklık kontrollü bir cam reaksiyon kabı içerisinde kalır. Her bozunma reaksiyonu sonunda, uçta bulunan amino asit anilinothiazolinone (ATZ) türevi olarak ayrılır. Daha sonra bu anilinothiazolinone (ATZ) türevi, daha kararlı bir forma, phenylthiohydantoin-amino acid (PTH-AA), dönüştürülmek üzere reaksiyon kabından, ısıtılmış ayrı bir dönüşüm erlenine aktarılır. Sonrasında PTH-AA dönüşüm erleninden sonra gelen ayırma ve Procise HPLC sisteminde sayısallaştırma işlemleri için dönüşüm erleninden enjeksiyon vanasına aktarılır.

PTH bağlı amino asitlerin ayrılması için sıcaklık kontrollü bir ısıtma bloğu içerisindeki bir ters-faz analitik kolon kullanılır. Farklı PTH-amino asitlerin kolona olan ilgilerinin farklı olması nedeniyle, kolondan farklı zamanlarda ayrılırlar.

Tam otomasyon sistemi 7 gün 24 saat çalışma sağlar.

Örnek Özellikleri

  • Örnekler yalnızca bir protein veya peptid içermelidir.
  • Örnekler Edman degredasyonunu ve sekanslama işlemini etkileyen maddeler içermemelidir (tampon, SDS, tuzlar, amino asitler, birincil aminler ve diğer bulaşıcı maddeler gibi)
  • Örnekler jelden polyvinylidene difluoride (PVDF) membrana transfer edilerek Coomassie blue, Ponseau S, or Amido black ile boyanmış şekilde veya solüsyon içerisinde bulunmalıdır.
  • PDVF membran üzerindeki örnekler, kontaminasyonu en aza indirmek için iyi ayrılmış bantlar halinde bulunmalıdır.
  • Başarılı bir sekanslama için gerekli protein/peptit miktarı, her sekanslama reaksiyonu başına 20-50 pmol'dur.

Uygulamaları

  • Dahili sekanslama
  • Yeni proteinlerin tespiti
  • Moleküler klonlama için prob tasarımı
  • Klonların genetik kararlılığının kontrolü
  • Rekombinant protein ürünlerin uygun işlenmesinin kontrolü

  © 2004-2005 ODTÜ MER-LAB 22/11/2008